1978年，中法两国在北京签署政府间科技合作协定，这是中国改革开放后与西方国家签订的第一个政府间科技合作协定。30多年来，中法科技合作广度和深度不断拓展，成果显著。中法科技合作的战略性和全球性特征日益凸显，从而推动和强化了中法整体关系，乃至中欧关系。
1992年，中法两国开始实施“中法先进研究计划（PRA）”，合作的领域包括：生物医学、生物技术、环境、信息、材料和地学等。在该计划实施的十年中，双方执行了近300个联合研发项目，培养了一大批年轻科研人员，孵化了一批中法联合实验室，取得了丰硕的成果。中法先进研究计划是我国和西方国家实施的第一个合作研究计划，提高了我国对外科技合作的水平和成效。
在中法两国政府间科技合作协定框架下，双方成立了科技合作联委会，至今已召开了13届科技合作联委会。最近的一届科技合作联委会--第13届中法科技合作联委会于2011年5月30日在巴黎举行，由中国科技部长万钢与时任法国高等教育与研究部长佩克莱斯共同主持。双方强调“产学研”合作，共同确定优先合作的六大领域为：可持续发展、生物多样性和水资源管理；绿色化学和技术；能源；生命科学；信息科学与技术、智慧城市；先进材料。
2013年4月，法国总统奥朗德对我国进行国事访问。两国领导人对中法科技合作予以了高度重视。在习近平主席和奥朗德总统的共同见证下，科技部长万钢与法方代表共同签署了《中华人民共和国科学技术部与法兰西共和国生产振兴部、法兰西共和国高等教育与研究部关于创新的联合声明》，建立中法创新对话工作机制。该机制旨在通过对话凝炼共识，促进中法产学研创新合作，为两国经济社会发展发挥支撑作用。
中法建交五十年来，特别是近三十年间，两国科技合作稳步发展，已形成多领域、多层次、多学科的喜人局面。随着中国科技水平的提高，中法两国的合作逐步从单向学习向合作研发推进，合作重点也从人员交流转向联合攻关和协同创新。双方在材料、生态技术、生命科学等领域的合作都已进入产学研合作的新阶段，合作更加强调成果转化和产业化，鼓励和吸引企业的参与。
中法双方业已开展的合作成果显著，例如：
1.联合实验室
1997中科院自动化所与法国国家信息与自动化研究院共同在北京成立了“中法信息、自动化与应用数学联合实验室”（LIAMA），开创了中法乃至中外科技合作搭建长期共同研究平台的先河。至今，中法联合实验室已发展到30多个，如中法催化联合实验室（大连）、中法哺乳动物胚胎细胞生物学联合实验室（北京）、中法超导体与磁性材料应用联合实验室（西安）、中法纳米生物与化学联合实验室（厦门）等。联合实验室已成为成果最实、方式最灵活、科研人员关系最密切的合作方式。上海巴斯德研究所的成立进一步深化了双方在联合科研机构方面的探索。
2.新发传染病防控
在2003年中国爆发SARS后，中法两国即开展了全面的新发传染病防控合作。双方在科研、法规、人才培养及高级别生物安全实验室建设等方面实施了卓有成效的合作。双方定期举行的研讨会、开展的联合研发项目等一系列合作行动为中国提升新发传染病的预防、研究和控制能力起到了积极作用，并为两国共同应对全球性的健康挑战做出贡献。
3.高新区与竞争力集群合作
2007年11月，法国总统萨科齐访华期间，在两国元首见证下，科技部长万钢与法国经济财政与就业部国务秘书共同签署了《关于中国高新区与法国竞争力集群的合作协议》。双方至今共召开了四次“中法创新集群论坛”，为双方高新园区和竞争力集群集聚的科技企业开展创新对接合作搭建平台。目前，双方已建立共同资助两国企业，特别是中小型高新技术企业开展“产学研”创新研发项目的合作机制。
4. 电动汽车合作
2001年科技部与法国工业部签署了“中法电动汽车合作项目备忘录”。2007年初又签署协议，同意支持先进动力电池合作研究,建立由方实验室和研究机构参与企业介入的协调组织平台。此外，科技部还积极推动两国电动汽车领域的示范和推广活动，如支持法国米其林公司于2007年11月在上海举办“必比登清洁汽车挑战赛”。
5.信息技术合作
为提升我国信息产业，尤其是软件产业的核心竞争力，2004年10月，在胡锦涛主席和法国总理希拉克的见证下，科技部与法国原子能委员会、法国布尔有限公司和法意半导体公司在北京共同签署了“中法信息技术合作框架协议”。国内各有关单位与法方在多核多线程CPU和软件中间件等项目上开展了紧密的信息技术合作。
5.肠道元基因组合作
科技部和法国国家科研署（ANR）于2006年签署了《关于肠道元基因组的科研合作声明》，共同启动人体肠道元基因组计划。这是我国参加到国际人类微生物组联盟（IHMC）的重要项目，通过代谢组学和元基因组学技术监控人类健康，将传统中医药与现代医学相结合。
6.生态环境合作
2008年中法双方开始了在水资源领域的合作，我国的重大专项之一--水专项与法国国家科研署资助的法方团队在水质量、水资源管理和保护等方面开展了联合研究开发。2013年1月，科技部与法国国家科研署进一步联合发布合作项目征集通知，推动双方大学、科研院所和企业在资源循环利用技术和环境整治技术等开展“产学研”合作。
7.在国际大科学等多边领域的合作
中法在国际大科学等多边合作框架下也取得了积极成果，对两国双边科技合作形成了有效补充。如双方国际热核聚变实验堆计划（ITER）、国际基因组计划等方面的合作，以及在面向基础和应用研究的欧盟研发框架计划和面向工业领域的尤里卡计划等方面的合作。
在两国科技合作联委会框架下，中法科研机构、大学和企业开展了卓有成效的合作，建立了稳固的合作关系，为提升双边科技创新合作作出了积极贡献。
