2002年是台湾军事体制实施转型、军文关系磨合调整的一年。在防卫构想方面，在美国支持下，台军继续鼓吹攻势战略，构建吓阻力量。为实现其防卫设想，台军还大力渲染大陆军事“威胁”，刻意夸大大陆“攻台”能力，增加了台海局势的不安。一、民进党当局对台军疑惧未消。

    鼓吹“台独”的民进党上台后，与台军互动成为敏感话题。两年多以来，虽然通过人事调整、灌输“台独”思想，陈水扁当局对台军的掌握度逐步增加，但民进党长期积累的对台军不信任和敌意并未完全消解，2002年内发生的几件事显示，“军文矛盾”依然严重。其一是在林毅夫回台事件上产生冲突。陈水扁当局迫于舆论和人道主义压力，曾一度考虑批准林的回台申请，但台军方态度强硬，坚决反对，军、文在这个问题上各吹各的调。尤其是2002年11月18日，台军方竟在事过几十年后，强行发布对林的所谓通缉令，有意抢先一步堵死未来民进党当局在这一事件上的选择。其二是在军中弊案问题上。过去民进党一直利用弊案攻击军方，2000年陈水扁上台后，下令组成由“检察总长”卢仁发任召集人的特检小组，查办拉斐叶特军购案，妄图利用弊案党同伐异。与此同时，“监察院”内的康宁祥等民进党势力也利用弊案弹劾许多前任与现任军方高层，彼此矛盾十分激烈。2002年“国防体制”改革时，内定文职“副部长”康宁祥因为担心引起军方反弹而一度不敢接任。其他事件还包括核武事件、“国安局秘账”事件等。3月底，针对媒体报道美核武报告将台海列为美动用核武对象一事，台“国防部”明确表达反对立场，汤曜明强调台海地区“非核化”的目标明确，不希望动用核子武器。这一立场遭到“国安系统”质疑，批评军方流于“制式思考”，忘了“团队分工与整体战略布局”。在刘冠军案和“国安局秘密账户”事件曝光后，台当局十分不满，要求军情系统严查泄密者，但一直没有进展。

    二、台军事体制出现大幅调整。

    2002年3月1日，台正式实施“国防二法”。至此，推动多年的军事体制改革进入落实阶段。新体制的特点主要有：

    （一）确立“军政军令一元化”。此次调整改变了过去“参谋本部主管军事事务”，“参谋总长在军令系统为总统僚长”的规定，明定“国防部掌管国防事务，下设参谋本部，是三军联合作战指挥机构”，“参谋总长”成为“国防部长”的军令幕僚。过去属“参谋本部”的各兵种“司令部”已随之改为“国防部某某总司令部”等。台军队高层架构依次为：“总统-国防部长-参谋总长与2位副部长-2位常务次长”。军令指挥体系是：“总统”责成“国防部长”，并再由“部长”授权“参谋总长”行使指挥、作战权。

    （二）仍存在许多矛盾。首先，台当局和美国吹嘘的“文人领军”远未实现。虽然民进党当局和美国都有意借军队体制改革之机加强对军方的控制，而且相关法规也要求“国防部”文人编制必须达到1/3，以确立所谓“军队国家化”，但一则由于民进党本身军事人才少，二则军方固有传统文化惯性极大，在2002年改革中，陈水扁仍不得不作出妥协。在“常务次长”以上的重要职位中，只有民进党元老康宁祥算是“文人”，美国在台协会台北办事处主任包道格对此讽刺说，“大概第一线的文人，很多都是刚退伍的军官”。

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