中国农业大学人文与发展学院教授左停说，城乡二元结构是导致我国农民权益受损的制度根源。因为，在城乡二元结构下，农民创造的部分物质财富，被拿走用于支持工业化和城市发展了。目前，我国大部分农村经济发展缺乏资金支持，城乡差距日益拉大。
在二元结构下，国家对农村基础设施、农村教育投入不足，忽视农村社保体系的建立，农民在占有公共物品和享有社会福利等社会资源的分配中处于劣势。例如，农民与市民相比，受教育的权利很不平等。70％的人口在农村，可是90％的学校在城里。目前约占总人口30％的城市人口享用了2／3的医疗卫生保障服务，而占总人口70％的农村人口享用的却不到1／3。
我国长期实行的城乡二元结构，把人口分为城市居民和农民，并将就业、住房、医疗、子女教育等公民权益同户口挂钩，形成了包括公民迁徙、劳动就业、教育、财产和社会保障在内的诸多方面对农民的不平等。
如何突破城乡二元结构，更好地保护农民权益，中国农大人文与发展学院院长李小云认为，应改变国民收入分配，变以农补工为工业反哺农业，改变资金在产业间的流向，增加对农业和农村的资金支持；改变国家涉农企业和农民间收入分配的比例，通过改变农业收入分配比例，减少农产品流通环节抢占农民的利益，增加农民的收入；提高农民在人大代表中的比例，保证农民代表参与决策的权利，并严格监督农村人大代表的选举；逐步取消城乡二元结构，实现自由迁徙和平等就业，保护农民工的权益。(记者 李健)
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解决好农民工问题的整体性政策框架
农民工问题是我国社会主义现代化进程中的一个重大战略问题。解决农民工问题的战略思路是：按照科学发展观和构建社会主义和谐社会的要求，坚持统筹城乡发展的方针，加快建立城乡统一的劳动力市场，逐步形成城乡劳动者平等就业的制度；加强劳动力市场制度建设，建立保护农民工合法权益的长效机制；公平对待农民工，逐步形成惠及农民工的城市基本公共服务制度；提高农村转移劳动力就业能力，保障农民工的土地承包权；进一步拓宽农村剩余劳动力转移渠道，引导农村劳动力合理有序流动，加快农村人口城镇化进程。
