红旗-16A防空导弹弹体采用了边条翼气动布局，这可以使导弹具有很强的大攻角飞行能力，可以更为有效地拦截来袭目标，甚至可拦截飞行速度在两马赫以上的目标。作为一种同时被海军和陆军采用的防空导弹，红旗-16A中程防空导弹做到了高低兼顾，而在对付低空目标方面尤其有效，最低射界在15米以下，可以有效对抗掠海飞行的反舰导弹，这一能力在多次海军演习中得到了验证。而作为陆军部队的伴随防空武器，红旗-16防空导弹的野战机动性很高，而且从行军状态转入开火状态仅需要13分钟。