海红旗-9是在陆基红旗-9防空导弹基础之上发展而来，据称红旗-9与俄罗斯S-300有很深的渊源，而S-300的舰载型号就是SA-N-6，因此海红旗-9的性能应该介于俄罗斯海军（RUS Navy）使用的SA-N-6和美国海军（US Navy）使用的标准-2ER之间。海红旗-9防空导弹的出口型号称为FD-2000。