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为了弥补医院医疗收入的不足，现行政策允许医院在将药品卖给患者时附一定比例的批零差价。这就成为医生往往喜欢多开药、开贵药的体制上的原因。医药公司在将药品批发给医院时，通常会给医院让利15％左右，这是国家允许的部分，叫“明扣”。但医院从医药公司那里还能拿到相当一部分灰色费用，大约在10％，这叫“暗扣”。
公开招标，一些价格低的当然可以中标，但就在药厂为自己中标而欢喜时，医院却用“该药效果不好”等理由，轻易就将这些没有利润空间的药品挤出医院。“以前招标中就遇到过药品抛出‘跳水价’的情形，但跳一个死一个。因为医院不欢迎降价药。”
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·处方流不出来，病人只能挨宰，医疗机构仍是药品销售主渠道 | ·处
病人在他们医院看病时所开的处方，基本上都是在本院取药。而对于粉针类静脉用药，目前北京几乎所有大医院都拒绝使用病人从医院外带来的药。认为一旦出了事，责任难辨。对口服处方药，病人的选择权似乎大一些，但服用后一旦有什么问题或是需要后续治疗时，由于对来自医院外的药难以把握，医生也都很难负责。不用病人自带药品是医院的一项常规，很难破掉。[详细阅读：我国药品8年16次降价 百姓为何仍难得实惠?
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